俗語有云“無規矩不成方圓”，每行每夜都有其需要遵循的原則，生物實驗室也有其需要遵循的原則。
1.安全原則：生物實驗室建設的目的之一就是要安全，在實驗室建設過程中遇到任何不利於安全的設計都是需要避免的。任何和生物安全發生衝突的引數設計都要服從安全性原則，比如：淨化需要服從安全，使用也要服從安全，節約要服從安全。
2.設計原則：建設之前要確定好對擬從事的原微生物以及研究的內容危險程度。一定要遵守科學的、合理的設計構思，在這個基礎上再按照操作的要求進行平面佈局設計，是要對空調的通風以及電控系統進行設計。
3.科學合理的原則：據悉，病原微生物只要沒有和人體進行接觸，那麼就不會有感染出現，所以在此類實驗室建設的重點就是保障能將病原體控制在一個規定的空間範圍內，避免讓其暴露在開放的環境當中，讓實驗室工作人員對其進行間接操作，在圍場當中接觸的空氣以及水體要經過處理之後進行排放。
4.管理原則：生物實驗室建設一定要遵守頒佈的相關建設管理條例進行性管理。這一條例對於致病微生物管理的原則是：對病原微生物進行分類管理，實驗室進行分級管理。
建設生物安全實驗室時一定要注意以上的這些原則並遵守，這樣才能確保終的實驗成果和實驗室工作人員的安全。